高宗原想不了了之，狄仁杰说：“国家即便再缺人才，也不会少他这样的人！陛下为什么要损害律法尊严替他开脱。如果您一定要赦免他，就请先把我流放远方，让那些替朝廷忠贞办事的大臣引以为戒。”王本立由此获罪，朝政为之肃然。
垂拱二年（686年），狄仁杰升任宁州（甘肃庆阳宁县）刺史，做了主政一方的长官。
他善抚百姓，颇有德政，受到民众爱戴。年底时，朝廷依例派监察御史郭翰巡视陇右。郭翰本着替高宗负责的态度，一路弹劾检举了多名不称职官员。
当他扮成百姓模样，进入宁州境内暗访时，发现称赞狄仁杰的百姓络绎不绝。郭翰大为惊异，随即将这事儿报给了朝廷。年已五十六岁的狄仁杰，因此被武则天征召入朝，出任工部侍郎，成了国家副部级高官。
这些年里，狄仁杰像是一盏明灯，放到哪里哪里亮。不论在哪个岗位、担负何种职务，都能干得有声有色。
他不吹不拍、不拉不扯、不贪不送，靠政绩、官声进身。特别是背景清白，从不拉帮结派，有经世报国的志向，无觊觎权力的野心，完全符合武则天的用人标准。
【02】抚百姓于罹难
如果说之前的狄仁杰职务较低，且远离权力核心，从而避免了许多不必要的纷争。那么自垂拱三年（687年）开始，身为朝中高官的他，也不可避免的被动卷入各种势力斗争中。
此时高宗已去世四年，继位的睿宗李旦只是一个摆设，朝政牢牢掌握在他母亲武则天手中。周兴、索元礼、来俊臣等酷吏闪亮登场，在武则天授意下，大搞罗织构陷！
垂拱四年（688年），李唐宗室博州刺史琅琊王李冲、豫州刺史越王李贞不甘坐等受诛，先后在博州（山东聊城）、豫州（河南驻马店汝南）起兵造反。由于准备过于仓促，加之实力有限，很快被朝廷派兵扑灭。
武则天借机对异己力量进行血腥清洗，大量官员坐罪处死，举国上下陷入肃杀氛围。
时任尚书左丞的狄仁杰奉命出任豫州刺史，这里是作乱的重灾区，阖境受越王李贞牵累坐罪的达六七百家，被判以抄家灭籍的有五千多口。
正直的狄仁杰不愿用别人的鲜血当成自己进步的阶梯，如实密奏武则天：“据臣调查，这些人都是无辜的，臣本想公开奏明，但有替逆党开脱之嫌；不说，又恐怕会违背您仁慈体恤的天性。”
武则天虽然心狠手辣，但她只针对挡她路、抢她权的政敌，并不是滥杀无辜的人，见狄仁杰说的在理，遂下令将豫州境内所有死囚改判为流放。
此时征讨越王李贞的官兵还逗留在豫州，他们倚仗平叛功劳，向州县索要财物，狄仁杰一律不准。统帅张光辅找狄仁杰理论，恼怒的质问：“你们区区州县，难道还敢轻视朝廷大军吗？”
狄仁杰正色答道：“您统率三十万官兵，所杀之人何止一个越王李贞！城中百姓听说朝廷派兵来了，主动出城归顺，您却放任军队杀害他们邀功取宠，以至城外尸横遍野、血流成河。请问，您和您的这帮兵与李贞有什么区别！我恨不能请到尚方宝剑，架在您脖颈上，就算死了，也了无遗恨！”
张光辅被噎的一句话也说不出来，恼怒的班师回朝，在武则天面前奏告狄仁杰傲慢无礼、出言不逊，蔑视朝廷大臣。
武则天清楚狄仁杰的为人，把他调往复州（湖北仙桃一带）任刺史，没再深究查办。豫州官员、百姓因此获安。
万岁通天元年（696年）五月，契丹首领李尽忠、孙万荣起兵作乱，杀死了营州都督赵文翙，又在峡石谷(河北唐山迁安县东北)设伏，大败唐军二十八员将领，先后进犯幽州（北京），攻陷冀州（河北衡水冀州区），围攻瀛州（河北沧州河间），引发河北震动。
危难时刻，武则天想起被贬到彭泽（今江西九江湖口县东南）当县令的狄仁杰，把他起用为魏州（河北邯郸大名附近）刺史，安抚当地民众，抗击契丹入侵。
前刺史独孤思庄担心契丹来袭，把城外居住的百姓全部赶进城里，帮着修缮城防。狄仁杰一上任，就让他们各自返家务农，还当众宣布：“敌人距我们还远，何必烦扰你们！万一他们来了，我自有办法退敌。”后来在突厥协助下，边患得以平息。
圣历元年（698年）八月，突厥默啜可汗以拥立李显、李旦即位为名，继契丹之后再次入侵河北，接连攻陷定州、赵州（河北赵县）。
武则天诏令狄仁杰为河北道行军副元帅带兵征讨，并亲自为他送行。
默啜眼见形势不妙，杀光了俘获的万余百姓，兵分五路撤出河北，狄仁杰随即转任安抚大使。
当初平定契丹时，前来安抚的武懿宗不问缘由，把遭契丹胁迫的平民全部杀掉。这次突厥进犯，同样逼迫许多百姓供其奴役驱使。突厥撤军，他们有鉴于昨，害怕再次遭到牵连诛杀，纷纷出城藏匿起来。
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