在又一次成功击败使徒后，大雄、哆啦A梦、胖虎和静香操控着EVA机体返回了NERV总部。
一路上，大家都沉浸在胜利的喜悦中，但同时也深知每一次与使徒的战斗都让他们更加明白这个世界的危险与复杂。
回到总部，科研人员们立刻忙碌起来，对鲸鱼使徒的残骸进行全面细致的研究。
大雄他们则拖着疲惫的身躯走向休息区，准备稍作休息后继续投入训练。
胖虎一屁股坐在椅子上，大大咧咧地说：“哈哈，这次又打赢了，我就说嘛，那些使徒再厉害也不是我们的对手！”
静香白了他一眼，无奈地说：“胖虎，你可别太得意了，每次战斗都那么惊险，我们能赢也是靠大家齐心协力，而且使徒每次出现都有新花样，谁知道下一次会遇到什么样的难题呢。”
大雄也点头赞同静香的话，说道：“是啊，静香说得对，我们不能掉以轻心。这次鲸鱼使徒利用海水攻击的方式就很棘手，还好我们想出了应对的办法。”
哆啦A梦从四次元口袋里掏出一些恢复能量的小零食，分给大家，说：“大家先吃点这个补充下能量吧，接下来的训练还得加油呢。经过这次战斗，我们又积累了不少经验，希望下次遇到使徒能更从容应对。”
众人接过零食，边吃边聊起了这次战斗的细节，互相分享着自己在战斗中的发现和感受。
然而，就在他们休息没多久，总部内突然响起了一阵急促的警报声。众人心中一惊，立刻停下手中的动作，朝着指挥室跑去。
一进指挥室，就看到大屏幕上显示出城市中心的一片繁华商业区出现了强烈的能量波动，而且这次的能量波动呈现出一种极为紊乱的状态，仿佛有多个强大的力量在相互冲突。
碇司令面色凝重，大声说：“驾驶员们，准备出击！这次的情况前所未有的复杂，从能量波动来看，可能不止一个使徒出现，大家一定要小心谨慎！”
大雄、哆啦A梦、胖虎和静香对视一眼，他们从彼此的眼中看到了担忧，但同时也有着坚定的决心。
“好的，司令，我们马上出发！”大雄坚定地说道。
众人迅速进入各自的EVA机体，启动后朝着能量波动的区域飞去。
当他们赶到现场时，眼前的景象让他们大为震惊。只见商业区的高楼大厦之间，多个巨大的身影在肆虐着。有一个形似巨大螃蟹的使徒，正用它那巨大的钳子不断地夹断高楼的支撑柱，导致高楼摇摇欲坠；还有一个如同巨大飞鸟的使徒，在空中盘旋着，时不时地俯冲向地面，用它尖锐的爪子撕裂着街道和建筑；另外，还有一个类似巨大蟒蛇的使徒，在街道上蜿蜒爬行，所到之处一片狼藉。
“哇，这次怎么这么多使徒啊！”大雄通过通讯器惊恐地喊道。
哆啦A梦一边用探测器扫描着周围的情况，一边严肃地说：“情况不妙啊，大家先别慌，我们得先观察一下它们的行动规律，看看能不能找到各个使徒的弱点，然后再制定作战计划。”
胖虎握紧了拳头，大声说：“哼，管它多少个使徒，一起上就是了，我就不信打不过它们！”
静香焦急地说：“胖虎，你别冲动呀，这么多使徒一起上，我们得小心应对，不能盲目攻击。”
就在这时，真嗣、明日香和渚薰等正式驾驶员也驾驶着EVA机体赶到了现场。
真嗣通过通讯器说：“大家先别急，我们先集合一下，商量个作战方案。这么多使徒，我们必须分工合作才能有胜算。”
众人纷纷响应，驾驶着EVA机体聚集到了一起。
经过一番简短的讨论，他们决定分成三组。大雄、哆啦A梦和胖虎为一组，负责对付那只巨大螃蟹使徒；真嗣、明日香和静香为一组，去应对巨大飞鸟使徒；渚薰则单独一组，牵制巨大蟒蛇使徒。
“大家记住，一定要注意安全，互相配合，有情况及时通过通讯器联系。”真嗣叮嘱道。
“好的，知道了！”众人齐声回应。
于是，三组人分别朝着各自负责的使徒飞去。
大雄、哆啦A梦和胖虎来到巨大螃蟹使徒面前。那螃蟹使徒看到他们靠近，立刻举起巨大的钳子，朝着他们夹了过来。
“大家小心！”哆啦A梦大喊一声，急忙操控机体躲避。
胖虎则兴奋地喊道：“看我来教训你这只大螃蟹！”说着，他操控着EVA机体朝着螃蟹使徒冲了过去，举起机体手中的武器，朝着螃蟹使徒的钳子就是一顿猛击。
大雄也不甘示弱，他一边躲避着螃蟹使徒的攻击，一边寻找着攻击的机会，然后瞅准时机，朝着螃蟹使徒的眼睛发射了一道能量光束。
螃蟹使徒吃痛，发出一声怒吼，它的钳子挥舞得更加猛烈了，同时还从嘴里喷出一股绿色的黏液，黏液朝着他们飞来，所到之处，地面和建筑都被腐蚀出一个个大坑。
“哎呀，这黏液好厉害，大家快躲开！”大雄惊叫道。
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